미스트롯2의 온라인 투표 방법은 크게 두 가지로 구분된다.
먼저, 첫 번째 방법은 네이버 앱이나 네이버 NOW 앱을 활용하는 응원 투표 방식이다. 이 방식은 방송 기간 동안 지속적으로 참여할 수 있는 방법으로, 네이버 앱 또는 NOW 앱을 실행하고 로그인한 뒤 검색창에서 미스트롯2를 입력해 관련된 투표 페이지로 접속하면 된다. 해당 페이지에서 ‘응원 투표’ 버튼을 선택하고 자신이 응원하고 싶은 참가자들을 최대 7명까지 선택하여 투표할 수 있다. 이 투표는 매일 1회 참여할 수 있으며, 매일 자정이 지나면 새롭게 투표권이 충전된다.
두 번째 방법은 준결승 및 결승 생방송 당일에만 참여 가능한 실시간 문자 투표 방식이다. 생방송이 진행되는 동안 프로그램 진행자가 문자 투표가 시작되었다는 안내를 하면, 휴대폰의 문자 메시지 창을 열고 수신번호에 ‘#4560’을 입력한 뒤 응원하고자 하는 참가자의 기호나 이름만 간단히 작성해 전송하면 된다. 문자 투표는 참가자 한 명당 한 번만 인정되며, 여러 명에게 각각 투표하는 것도 가능하다. 단, 문자 전송 시 건당 100원의 요금이 부과되며, 방송에서 지정한 시간 내에 보낸 메시지만 유효하다.
이 두 가지 방식의 온라인 투표 결과는 미스트롯2 참가자들의 최종 순위를 결정짓는 데 중요한 역할을 한다. 평소 응원하는 참가자에게 꾸준히 힘을 실어주기 위해 매일 네이버 앱으로 투표하는 것이 좋으며, 생방송 당일에는 문자 투표를 통해 결정적인 지지를 표현할 수 있다.